MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 6897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009484	CGG	2	6	2291914	2291919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_009484	TCT	2	6	2291955	2291960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_009484	GCC	2	6	2291977	2291982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_009484	CGC	2	6	2291988	2291993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4505	NC_009484	ATC	2	6	2291995	2292000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_009484	GCC	2	6	2292013	2292018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_009484	GGCGC	2	10	2292026	2292035	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4508	NC_009484	CGTCG	2	10	2292059	2292068	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4509	NC_009484	CGCC	2	8	2292144	2292151	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4510	NC_009484	CGC	2	6	2292153	2292158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_009484	CGC	3	9	2292167	2292175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_009484	GCCCGC	2	12	2292176	2292187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_009484	GCCCG	2	10	2292197	2292206	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4514	NC_009484	GCCGC	2	10	2292228	2292237	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4515	NC_009484	GCTG	2	8	2292242	2292249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_009484	CCG	3	9	2292272	2292280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_009484	CGC	2	6	2292330	2292335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_009484	TCC	2	6	2292356	2292361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_009484	CGC	2	6	2292418	2292423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_009484	GCC	3	9	2292445	2292453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_009484	CCG	2	6	2292457	2292462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_009484	GCCCG	2	10	2292476	2292485	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4523	NC_009484	CGCC	2	8	2292502	2292509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4524	NC_009484	GCC	2	6	2292512	2292517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_009484	CG	4	8	2292518	2292525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_009484	CCGC	2	8	2292526	2292533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4527	NC_009484	C	6	6	2292566	2292571	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4528	NC_009484	CGC	2	6	2292581	2292586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_009484	CG	4	8	2292597	2292604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_009484	GC	3	6	2292651	2292656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_009484	CCG	2	6	2293299	2293304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_009484	GCC	5	15	2293350	2293364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_009484	CGC	2	6	2293391	2293396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_009484	CCA	2	6	2293399	2293404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_009484	GC	3	6	2293411	2293416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_009484	GCG	2	6	2308778	2308783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_009484	CCGCGC	2	12	2308789	2308800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4538	NC_009484	CAT	2	6	2308819	2308824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_009484	GC	3	6	2308839	2308844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_009484	CGC	2	6	2308854	2308859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_009484	TCCA	2	8	2308870	2308877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_009484	GCC	2	6	2308878	2308883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_009484	TTC	2	6	2308894	2308899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_009484	GAG	2	6	2308944	2308949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_009484	GCGT	2	8	2309021	2309028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_009484	TCG	2	6	2309057	2309062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_009484	GCC	2	6	2310938	2310943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_009484	GCCG	2	8	2310946	2310953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_009484	CGG	2	6	2310955	2310960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_009484	TGC	2	6	2310962	2310967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_009484	CG	3	6	2311015	2311020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_009484	ATC	2	6	2322779	2322784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_009484	TC	3	6	2325056	2325061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_009484	CCCG	2	8	2325072	2325079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4555	NC_009484	CGGG	2	8	2325082	2325089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_009484	TTCA	2	8	2326471	2326478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_009484	CGG	2	6	2329141	2329146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_009484	GC	3	6	2329147	2329152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_009484	TCC	2	6	2335769	2335774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_009484	CGTC	2	8	2335925	2335932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_009484	GTG	2	6	2335936	2335941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_009484	TCGGGT	2	12	2337191	2337202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4563	NC_009484	CCGG	2	8	2337279	2337286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_009484	CCA	2	6	2337335	2337340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_009484	CGG	3	9	2339029	2339037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_009484	CCGC	2	8	2339049	2339056	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4567	NC_009484	GGGGT	2	10	2339068	2339077	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_009484	CAT	2	6	2340365	2340370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_009484	GC	3	6	2340378	2340383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_009484	CTC	2	6	2341529	2341534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_009484	GGC	2	6	2341561	2341566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_009484	GC	3	6	2341565	2341570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_009484	CG	3	6	2341629	2341634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_009484	CAG	2	6	2341666	2341671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_009484	CTGG	2	8	2351859	2351866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4576	NC_009484	CGC	2	6	2351915	2351920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_009484	CGG	2	6	2351943	2351948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_009484	CGC	2	6	2352029	2352034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_009484	CGCGC	2	10	2352598	2352607	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4580	NC_009484	CA	3	6	2352618	2352623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_009484	GGC	2	6	2352640	2352645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_009484	GCGCGG	2	12	2352689	2352700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_009484	ATC	2	6	2352707	2352712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_009484	CCG	2	6	2356538	2356543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_009484	TCG	2	6	2356561	2356566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_009484	CAC	2	6	2356573	2356578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_009484	GAT	2	6	2357713	2357718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_009484	T	7	7	2357762	2357768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_009484	TTC	2	6	2357822	2357827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_009484	GACC	2	8	2357832	2357839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_009484	GCC	2	6	2357841	2357846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_009484	CGG	2	6	2357866	2357871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_009484	CTG	2	6	2357887	2357892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_009484	GTT	2	6	2357921	2357926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_009484	GTC	2	6	2357939	2357944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_009484	GCA	2	6	2358063	2358068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_009484	TGT	2	6	2358106	2358111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_009484	CGG	2	6	2361364	2361369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_009484	TTG	2	6	2361381	2361386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_009484	GGAC	2	8	2361412	2361419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4601	NC_009484	CGGA	2	8	2361435	2361442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4602	NC_009484	CGG	2	6	2361475	2361480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_009484	ACC	2	6	2361494	2361499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_009484	GCG	2	6	2364145	2364150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_009484	CCGC	2	8	2364783	2364790	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4606	NC_009484	GGC	2	6	2365843	2365848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_009484	CGG	2	6	2365852	2365857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_009484	CCG	2	6	2365863	2365868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_009484	GGC	2	6	2365869	2365874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_009484	CG	3	6	2365885	2365890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_009484	CCGG	2	8	2367581	2367588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_009484	GGACG	2	10	2367590	2367599	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4613	NC_009484	AGC	2	6	2367656	2367661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_009484	CAG	2	6	2369074	2369079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_009484	GAT	2	6	2369200	2369205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_009484	TCC	2	6	2371930	2371935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_009484	GGC	2	6	2371953	2371958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_009484	GCC	2	6	2371971	2371976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_009484	GTC	2	6	2373112	2373117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_009484	TC	3	6	2373116	2373121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_009484	CGG	2	6	2373137	2373142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_009484	TGG	2	6	2373143	2373148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_009484	GCGGG	2	10	2373150	2373159	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4624	NC_009484	TCC	2	6	2375192	2375197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_009484	CGGG	2	8	2375215	2375222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4626	NC_009484	GGC	2	6	2375290	2375295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_009484	TGC	2	6	2375338	2375343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_009484	GCGG	2	8	2375344	2375351	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4629	NC_009484	CGC	2	6	2375354	2375359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_009484	CGG	2	6	2375361	2375366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_009484	AGT	2	6	2377400	2377405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_009484	GGC	2	6	2377412	2377417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4752	NC_009484	C	6	6	2422919	2422924	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4757	NC_009484	GC	3	6	2423025	2423030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4758	NC_009484	CGGCG	2	10	2423826	2423835	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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